Zespół działa na podstawie zarządzenia Ministra Zdrowia z dnia 15 listopada 2010 r. w sprawie powołania Zespołu do spraw zapobiegania i zwalczania zakażeń i chorób zakaźnych u ludzi (Dz. Urz. Min. Zdrow. poz. 75 z późn. zm.).

W Skład zespołu wchodzą:
1) Przewodniczący Zespołu - Sekretarz albo Podsekretarz Stanu w Ministerstwie Zdrowia nadzorujący prace Departamentu Zdrowia Publicznego;
2) Zastępca Przewodniczącego Zespołu - Główny Inspektor Sanitarny;
3) Sekretarz Zespołu - przedstawiciel Głównego Inspektoratu Sanitarnego;
4) Zastępca Głównego Inspektora Sanitarnego;
5) Przewodniczący Komisji Epidemiologii Chorób Zakaźnych i Szczepień Ochronnych Rady Sanitarno-Epidemiologicznej;
6) Dyrektor Rządowego Centrum Bezpieczeństwa;
7) Dyrektor Departamentu Przeciwepidemicznego i Ochrony Sanitarnej Granic w Głównym Inspektoracie Sanitarnym;
8) Główny Inspektor Farmaceutyczny;
9) przedstawiciel Biura Współpracy Międzynarodowej w Ministerstwie Zdrowia;
10) przedstawiciel Departamentu Zdrowia Publicznego w Ministerstwie Zdrowia;
11) przedstawiciel Departamentu Polityki Lekowej i Farmacji w Ministerstwie Zdrowia;
12) przedstawiciel Departamentu Analiz i Strategii w Ministerstwie Zdrowia;
13) przedstawiciel Departamentu Rozwoju Kadr Medycznych w Ministerstwie Zdrowia;
14) przedstawiciel Departamentu Bezpieczeństwa w Ministerstwie Zdrowia;
15) przedstawiciel Biura Komunikacji w Ministerstwie Zdrowia;
16) Prezes Urzędu Rejestracji Produktów Leczniczych, Wyrobów Medycznych i Produktów Biobójczych;
17) przedstawiciel Narodowego Funduszu Zdrowia;
18) Główny Lekarz Weterynarii;
19) Główny Inspektor Sanitarny Wojska Polskiego;
20) Komendant Centrum Reagowania Epidemiologicznego Sił Zbrojnych Rzeczypospolitej Polskiej;
21) Naczelny Lekarz Ministerstwa Spraw Zagranicznych;
22) przedstawiciel Ministerstwa Finansów;
23) przedstawiciel Komendy Głównej Straży Granicznej;
24) przedstawiciel Szefa Urzędu do Spraw Cudzoziemców;
25) Dyrektor Narodowego Instytutu Zdrowia Publicznego - Państwowego Zakładu Higieny;
26) Kierownik Zakładu Epidemiologii Chorób Zakaźnych i Nadzoru w Narodowym Instytucie Zdrowia Publicznego - Państwowym Zakładzie Higieny;
27) Dyrektor Wojskowego Instytutu Higieny i Epidemiologii;
28) Konsultant Krajowy w dziedzinie chorób zakaźnych;
29) Konsultant Krajowy w dziedzinie epidemiologii;
30) Konsultant Krajowy w dziedzinie pielęgniarstwa epidemiologicznego;
31) Konsultant Krajowy w dziedzinie pediatrii;
32) Konsultant Krajowy w dziedzinie zdrowia publicznego;
33) Konsultant Krajowy w dziedzinie mikrobiologii lekarskiej;
34) Konsultant Krajowy w dziedzinie medycyny rodzinnej;
35) Konsultant Krajowy w dziedzinie diagnostyki laboratoryjnej;
36) przedstawiciel Ministerstwa Edukacji i Nauki.

W ramach Zespołu działają Komitety:
1) Krajowy Komitet do spraw Pandemii Grypy,
2) Krajowy Komitet do spraw Eliminacji Poliomyelitis,
3) Krajowy Komitet do spraw Eliminacji Odry i Różyczki,
4) Krajowy Komitet do spraw Gruźlicy,

Składy komitetów określone są odpowiednio w załącznikach 1, 2, 3 i 4 do powyższego zarządzenia.