Dokonywanie analiz i ocen epidemiologicznych oraz występujących zagrożeń epidemicznych dla województwa opolskiego.
Nadzór nad wykonywaniem zadań związanych z zapobieganiem i zwalczaniem chorób zakaźnych, pasożytniczych i odzwierzęcych, zwłaszcza w ogniskach chorób szerzących się epidemicznie.
Nadzór i kierowanie akcją sanitarną i przeciwepidemiczną w przypadku ataku bioterrorystycznego, zachorowań na szczególnie niebezpieczną i wysoce zakaźną chorobę lub masowych przemieszczeń i zgromadzeń ludności.
Organizacja i nadzór nad zabiegami dezynfekcji, dezynsekcji i deratyzacji związanych z wystąpieniem zachorowań na choroby zakaźne wskutek awarii i klęsk żywiołowych.
Nadzorowanie, koordynacja i kontrola realizacji szczepień ochronnych w województwie opolskim.
Sporządzanie ocen i analiz z wykonania szczepień ochronnych w województwie.
Bieżący nadzór nad warunkami sanitarnymi i higienicznymi w podmiotach wykonujących działalność leczniczą.
Współpraca z innymi podmiotami sprawującymi nadzór sanitarno-epidemiologiczny, epizootyczny oraz w zakresie ochrony środowiska ( Państwową Inspekcją Sanitarną MSWiA i MON, Służbą Więzienną oraz Państwową Inspekcją Weterynaryjną, Inspekcją Ochrony Środowiska).