Do zadań Laboratorium Mikrobiologii i Parazytologii należy:
wykonywanie badań z zakresu mikrobiologii medycznej tj.
badań próbek kału od osób z ognisk chorób przenoszonych drogą pokarmową w kierunku biologicznych czynników chorobotwórczych,
badań sanitarno-epidemiologicznych wykonywanych w ramach nadzoru epidemiologicznego w celu wykrycia biologicznych czynników chorobotwórczych lub potwierdzenia rozpoznania choroby zakaźnej u nosicieli, ozdrowieńców oraz osób, które były narażone na zakażenia przez styczność z osobami zakażonymi, chorymi lub materiałem zakaźnym,
badań próbek kału w kierunku nosicielstwa pałeczek chorobotwórczych z rodzaju Salmonella i Shigella, pochodzących od osób podejmujących lub wykonujących prace oraz uczniów, studentów i doktorantów kształcących się do wykonywania prac, przy wykonywaniu których istnieje możliwość przeniesienia zakażenia lub choroby zakaźnej na inne osoby,