Centrum Projektów Polska Cyfrowa

Cel projektu

Głównym celem projektu jest udostępnienie genetycznych zasobów Biobanku Uniwersytetu Łódzkiego i Katedry Antropologii Uniwersytetu Łódzkiego na platformie dostępnej w Internecie, w sposób łatwy dla każdego i umożliwiający ponowne wykorzystanie dostępnych danych.

Cenne informacje, będące wynikiem analiz danych uzyskanych przez badaczy z UŁ, umieszczono na platformie skierowanej internautów.

„Chcemy przyczynić się do wyznaczenia nowych standardów w dziedzinie cyfrowego udostępniania danych naukowych.” - powiedział mgr inż. Błażej Marciniak, współtwórca projektu, pracownik Biobanku Łódź Uniwersytetu Łódzkiego.

 

Co znajdziemy na stronie projektu e-Człowiek.pl?

Na platformie przedstawiona została szeroka charakterystyka antropologiczna i genetyczna populacji ludzkich centralnej Polski w okresie od Państwa Piastów do początku XIX wieku. Zaprezentowane zostały również, przetworzone na potrzeby portalu, dane genetyczne dotyczące współczesnych Polaków, np. w kontekście czynników ryzyka chorób cywilizacyjnych i częstości występowania osób narażonych na wystąpienie choroby.

„Projekt przyczyni się w sposób przełomowy do wzrostu ilości publicznie dostępnych danych - siedem miliardów pól danych na temat ludzkiego genomu (polskiej populacji na próbie 6400 osób) czeka na udostępnienie. Ponadto zbiór zostanie wzbogacony o zasoby Katedry Antropologii. Poznamy blisko 200 genomów Polaków na przestrzeni ośmiuset lat” - dodaje Błażej Marciniak.

Planowany do realizacji zakres cyfryzacji kolekcji szkieletowej z okresu od XI do początku XIX wieku, pochodzącej z pięciu stanowisk archeologicznych (cmentarzysk) zlokalizowanych w rejonie Brześcia Kujawskiego na Kujawach, obejmie pozyskanie cyfrowego zapisu sekwencji aDNA (ancient DNA - DNA starożytne).

Informacje uzyskane w toku badań zostały uzupełnione materiałem z innych badań populacyjnych wśród Polaków żyjących obecnie. To ogromne osiągnięcie, ponieważ możemy w ten sposób dowiedzieć się więcej o naszych przodkach i porównać ich do obecnie żyjących ludzi. Ciekawostką jest zamieszczenie map z częstotliwością występowania w genomie ludzkim polimorfizmów – wariantów, które zmniejszają lub zwiększają możliwość wystąpienia chorób cywilizacyjnych oraz nowotworowych na danym obszarze kraju.

 

Jak doszło do powstania projektu?

-W ostatnich dziesięcioleciach każdego dnia ośrodki naukowo-badawcze generują ogromne ilości danych (big data - wielkie dane) o znacznej wartości naukowej. W Polsce wdrażanie nowych rozwiązań, takich jak porządkowanie i ułatwianie dostępu do danych naukowych w dalszym ciągu jest mało popularną praktyką. Źródłem tego problemu jest, między innymi, brak otwartości kadry naukowo-badawczej na proces ogólnoświatowej cyfryzacji ściśle związany ze specyfiką zawodu i reguł panujących w placówkach badawczych - powiedział Błażej Marciniak.

„W erze wielkich danych największym wyzwaniem nie jest samo przeprowadzanie eksperymentów badawczych, lecz możliwość opracowania systemu łatwej wymiany danych i co najważniejsze przeprowadzenie właściwej ich analizy. Dane udostępnione na platformie e-Czlowiek.pl będą podstawą dla różnego rodzaju analiz, raportów, pozwolą na zdefiniowanie zagrożeń zdrowotnych i wdrożenie w miejscach, gdzie to konieczne, odpowiednich programów informacyjnych lub profilaktycznych” – dodał mgr inż. Błażej Marciniak.

Jednostka Biobank Łódź Uniwersytetu Łódzkiego współtworzy Polską Sieć Biobanków.

 

Grupy docelowe:

• jednostki naukowo-badawcze
• studenci i doktoranci
• nauczyciele nieakademiccy i uczniowie
• obywatele
• placówki diagnostyczne (medycyna spersonalizowana)

 

Sprawdź możliwości platformy: https://e-czlowiek.pl/web/guest

 

Dane projektu

Nazwa projektu: Cyfrowe udostępnianie zasobów biomolekularnych i opisowych Biobanku i Katedry Antropologii Uniwersytetu Łódzkiego – charakterystyka populacji zamieszkujących tereny dzisiejszej Polski na przestrzeni dziejów. Platforma informacyjna e-Czlowiek.pl.

Beneficjent: UNIWERSYTET ŁÓDZKI

Finansowanie

Program: Program Operacyjny Polska Cyfrowa

Działanie: 2.3. Cyfrowa dostępność i użyteczność informacji sektora publicznego, poddziałanie: 2.3.1. Cyfrowe udostępnienie informacji sektora publicznego ze źródeł administracyjnych i zasobów nauki

Wartość projektu: 6 669 971,00 zł

Wydatki kwalifikowalne: 6 669 971,00 zł

Wartość unijnego dofinansowania: 5 644 796,45 zł