Kierując się dobrem wnioskodawców oraz zasadą równego traktowania, Operator Programu dokonał aktualizacji Regulaminu w dwóch trwających jeszcze naborach tj. dot. Zwiększenia wydajności wytwarzania energii w istniejących małych elektrowniach wodnych (do 2 MW) oraz Budowy źródeł ciepła wykorzystujących energię geotermalną (geotermia głęboka).

Wnioskodawcy we wszystkich naborach głównych z obszaru środowiska, klimatu (poza naborem pilotażowym dot. GOZ) i energii (poza planowanym do ogłoszenia naborem pilotażowym) w przypadku pozostawienia ich wniosku bez rozpatrzenia mają prawo do wniesienia odwołania - na zasadach opisanych w pismach informujących o wynikach oceny/pozostawieniu wniosku bez rozpatrzenia.