3SI została powołana do życia przez Polskę i Chorwację w 2015 r. Obecnie skupia 13 państw członkowskich Unii Europejskiej (Austria, Bułgaria, Chorwacja, Czechy, Estonia, Litwa, Łotwa, Polska, Rumunia, Słowacja, Słowenia, Węgry i Grecja), położonych między Adriatykiem, Bałtykiem i Morzem Czarnym.

Ukraina, Mołdawia, Albania i Czarnogóra są stowarzyszonymi państwami uczestniczącymi w 3SI. Partnerami strategicznymi 3SI są USA, Komisja Europejska, Niemcy, Japonia, Turcja, Hiszpania i Włochy.

Do tej pory zorganizowano 11 szczytów 3SI na poziomie głów państw i rządów – w Dubrowniku (2016 r.), Warszawie (2017 r.), Bukareszcie (2018 r.), Lublanie (2019 r.), Tallinnie (2020 r.), Sofii (2021 r.), Rydze (2022 r.) i Bukareszcie (2023 r.), Wilnie (2024 r.), Warszawie (2025 r.) i Dubrowniku (2026 r.). Obyło się także 8 Forów Biznesu, które towarzyszą Szczytom od 2018 r. i gromadzą przedstawicieli środowisk biznesowych. Kolejny Szczyt i Forum Biznesu odbędą się I połowie 2027 r. na Słowacji, która sprawuje aktualnie nieformalne przewodnictwo w 3SI.

3SI jest nieformalną platformą współpracy regionalnej. Jedyną zinstytucjonalizowaną formą współpracy pozostają wehikuły inwestycyjne Inicjatywy:

• Fundusz Trójmorza (Three Seas Initiative Investment Fund) jest wehikułem inwestycyjnym służącym do finansowania kapitałowego kluczowych projektów infrastrukturalnych w regionie Trójmorza.
• Fundusz Innowacji Trójmorza (Thee Seas Initiative Innovation Fund) jest wehikułem inwestycyjnym działającym w formie funduszu funduszy, który ma na celu wspieranie spółek w fazie wzrostu w Europie Środkowo-Wschodniej.

28 kwietnia 2026 r., na marginesie 11. Szczytu i 8. Forum Biznesu 3SI w Dubrowniku, Bank Gospodarstwa Krajowego (BGK) oraz narodowe banki rozwoju Chorwacji (HBOR), Rumunii (BID), Litwy (ILTE) oraz Słowenii (SID Banka) podpisały list intencyjny, które zakłada możliwość utworzenia Funduszu Funduszy Infrastrukturalnych 3SI (Three Seas Initiative Infrastructure Fund of Funds), zarządzanego przez Europejski Fundusz Inwestycyjny (EFI).  Jego celem jest mobilizacja co najmniej 2 mld euro (tj. ok. 8,5 mld zł) w rozwój infrastruktury w regionie 3SI.