W 2025 r. Departament Współpracy Terytorialnej Ministerstwa Funduszy i Polityki Regionalnej działając jako instytucja zarządzająca lub instytucja krajowa w programach Interreg przeprowadził 15 kontroli systemowych.

Kontrolami zostały objęte wspólne sekretariaty oraz krajowi kontrolerzy w programach Interreg