Uroczystości pogrzebowe miały miejsce w kościele pw. Najświętszego Serca Pana Jezusa w Starej Miłosnej.
W uroczystościach wzięli też udział m.in. prezydent Andrzej Duda, członkowie rządu i parlamentarzyści, a także marszałek Sejmu Elżbieta Witek, marszałek Senatu Stanisław Karczewski oraz prezes PiS Jarosław Kaczyński.

Prof. Jan Szyszko został pośmiertnie odznaczony Krzyżem Komandorskim z gwiazdą orderu Odrodzenia Polski za wybitne osiągnięcia w podejmowanej z pożytkiem dla kraju działalności państwowej i publicznej.