Jedną z najważniejszych zmian jest objęcie rządowym wsparciem budowy dróg krajowych w miastach na prawach powiatu (z wyjątkiem miast wojewódzkich będących siedzibą wojewody lub sejmiku), które stanowią część zadań ujętych w rządowych programach drogowych, takich jak Rządowy Program Budowy Dróg Krajowych czy program obwodnicowy. Chodzi o zadania realizowane przez Generalną Dyrekcję Dróg Krajowych i Autostrad, przebiegające przez tereny samorządów, które są na mocy ustawy o drogach publicznych zobligowane do proporcjonalnego partycypowania w kosztach inwestycji. To odpowiedź na postulaty władz miast na prawach powiatu, mierzących się z problemem niedostatecznych środków finansowych na inwestycje na drogach krajowych. Zewnętrzne wsparcie umożliwi w pełni realizację inwestycji ujętych w programach rządowych.

W latach 2027–2030 do Funduszu trafi dodatkowo 2,6 mld zł z budżetu państwa na dofinansowanie nowych zadań. Środki te pozwolą wesprzeć inwestycje na zarządzanych przez samorządy drogach krajowych, inwestycje i remonty na drogach powiatowych i gminnych oraz budowę mostów.

Ponadto zaplanowano zwiększenie wpłat do Funduszu z budżetu Ministerstwa Obrony Narodowej z 500 mln zł do 1 mld zł w latach 2031–2035. W zakresie zadań obronnych umożliwiony zostanie udział finansowy samorządów w inwestycji. Obecnie możliwe jest wyłącznie pełne finansowanie inwestycji przez MON.

Kolejna zmiana zakłada włączenie przedstawiciela marszałka województwa do komisji oceniającej wnioski samorządów. Nowe przepisy przewidują, że listy zadań do dofinansowania będą zatwierdzane przez ministra właściwego do spraw transportu (obecnie jest to zadanie Prezesa Rady Ministrów), co oznacza wzmocnienie kompetencji ministra właściwego do spraw transportu w zakresie koordynacji realizacji zadań wynikających z ustawy o RFRD, co postulowała Najwyższa Izba Kontroli. Minister Infrastruktury będzie mógł również wydawać wiążące wytyczne dotyczące zadań RFRD dla wojewodów.

Zaproponowano również wydłużenie wypłat środków z Funduszu na dofinansowanie lub sfinansowanie zadań oraz ich rozliczenie o dodatkowe 3 lata, tj. do 31 grudnia 2038 r. W tym zakresie wydłuża się również obowiązywanie ustawy o RFRD do końca roku 2038.

Projekt przewiduje także powrót do wcześniejszej nazwy Funduszu – „Fundusz Dróg Samorządowych”. Nie będzie też konieczności umieszczanie przy inwestycjach tablic informacyjnych o dofinasowaniu zadania ze środków Funduszu.