Do zadań Zespołu należy:

1. opracowywanie opinii i ekspertyz w zakresie szczepień ochronnych na wniosek Ministra lub Przewodniczącego;
2. dokonywanie analizy aktualnego programu szczepień ochronnych pod kątem spójności z bieżącą sytuacją epidemiologiczną na terytorium Rzeczypospolitej Polskiej i na świecie oraz regulacjami z zakresu szczepień ochronnych stosowanymi w Unii Europejskiej, jak i dostępnymi preparatami szczepionkowymi;
3. opiniowanie projektu Programu Szczepień Ochronnych (PSO) na każdy rok kalendarzowy;
4. opracowywanie i opiniowanie długofalowej strategii szczepień ochronnych;
5. opracowywanie i opiniowanie propozycji zmian legislacyjnych w zakresie szczepień ochronnych;
6. wyrażanie opinii w innych sprawach z zakresu szczepień ochronnych niż wymienione w pkt 1-5;
7. wsparcie merytoryczne i naukowe Ministra w sprawach szczepień ochronnych objętych zakresem działania Ministra.

Stanowiska i rekomendacje Zespołu ds. szczepień ochronnych w zakresie szczepień przeciw COVID-19:

1. Rekomendacja Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dla Ministra Zdrowia dotycząca określenia grup szczególnie narażonych na zachorowanie wywołane przez wirusa SARSCoV-2, które wymagałyby objęcia szczepieniami (13.07.2020).
2.  Rekomendacja Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dla Ministra Zdrowia dotycząca strategii szczepień przeciwko COVID-19 (02.11.2020).
3. Rekomendacje Zespołu ds. Szczepień w rozszerzonym składzie dotyczące rozszerzenia uprawnień do kwalifikacji oraz wykonywania szczepień dorosłych przeciw COVID-19 oraz wymaganego zakresu szkoleń (30.11.2020)
4.  Rekomendacje Zespołu ds. Szczepień w rozszerzonym składzie dotyczące kwestionariusza kwalifikacyjnego dla osoby dorosłej do szczepienia przeciw COVID-19 (16.12.2020)
5. Rekomendacje Zespołu ds. Szczepień w rozszerzonym składzie dotyczące kwestionariusza kwalifikacyjnego dla osoby dorosłej do szczepienia przeciw COVID-19 (16.12.2021).
6.  Instrukcja dla lekarza do kwestionariusza wstępnego wywiadu przesiewowego przed szczepieniem osoby dorosłej przeciw COVID-19 (26.01.2021).
7.  Rekomendacja Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dla Ministra Zdrowia dotyczące szczepionki wektorowej AstraZeneca (ChAdOx1-S) (08.02.2021).
8. Rekomendacja Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dotycząca szczepionki wektorowej AstraZeneca (ChAdOx1-S) (26.02.2021).
9. Rekomendacja Zespołu ds. Szczepień dotycząca szczepień przeciw COVID-19 osób z potwierdzoną wcześniejszą infekcją SARS-CoV-2 (05.03.2021).
10.  Stanowisko w sprawie uaktualnienia Instrukcji do kwestionariusza wstępnego wywiadu przesiewowego przed szczepieniem osoby dorosłej przeciw COVOD-19, uwzględniającej rozszerzony zakres personelu uprawniającego do kwalifikacji do szczepienia przeciw COVID-19. (14.04.2021).
11. Stanowisko Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dotyczące odstępów miedzy dawkami szczepionek przeciw COVID-19 (11.05.2021).
12. Rekomendacja Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dotycząca kwalifikacji do szczepienia przeciw COVID-19 preparatem Comirnaty dla osób w wieku od 12 do 15 lat (ą szczepionki Covishield i listy szczepionek przeciw COVID-19 uznanych za odpowiadające szczepionkom, które zostały dopuszczone do obrotu w krajach Unii Europejskiej (02.06.2021).
13. Rekomendacje Zespołu ds. Szczepień dotyczące kwalifikacji do szczepienia przeciw COVID-19 preparatem Comirnaty dla osób w wieku od 12 do 15 lat (02.06.2021).
14. Rekomendacja Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dotycząca mieszanych schematów szczepień przeciw COVID-19 (02.07.2021).
15. Rekomendacja Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dotycząca szczepionki Covishield i listy szczepionek przeciw COVID-19 uznanych za odpowiadające szczepionkom, które zostały dopuszczone do obrotu w krajach Unii Europejskiej (18.08.2021).
16. Rekomendacja Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dla Ministra Zdrowia dotycząca podawania dodatkowej (trzeciej) dawki szczepionek przeciw COVID-19 osobom z ciężkim lub umiarkowanym upośledzeniem odporności (01.09.2021)
17. Rekomendacja Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dla Ministra Zdrowia dotycząca podawania przypominającej dawki szczepionek przeciw COVID-19 oraz dawki uzupełniającej szczepionki Spikevax (25.10.2021).
18. Stanowisko Zespołu w sprawie kwalifikacji do szczepień przeciw COVID-19 dzieci w wieku 5-11 lat (25.11.2021).
19. Stanowisko Zespołu w sprawie szczepień przeciw COVID-19 dzieci w wieku 5-11 lat (07.12.2021).
20. Stanowisko Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dla Ministra Zdrowia dotyczące mieszanych schematów szczepień przeciw COVID-19 (17.12.2021).
21. Stanowisko Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dla Ministra Zdrowia dotyczące stosowania dawki przypominającej w schemacie szczepienia przeciw COVID-19 u młodzieży w wieku 16-18 lat (24.01.2022).
22. Stanowisko Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dla Ministra Zdrowia dotyczące stosowania dawki przypominającej w schemacie szczepienia przeciw COVID-19 u nastolatków w wieku 12-15 lat (26.01.2022).
23.  Rekomendacje Zespołu ds. Szczepień w rozszerzonym składzie eksperckim1 dotyczące kwestionariuszy wstępnego wywiadu przesiewowego przed szczepieniem przeciw COVID-19 (04.02.2022).
24. Stanowisko Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dla Ministra Zdrowia dotyczące szczepień przeciw COVID-19 u pacjentów po zabiegu HCT lub terapii CAR-T, u których szczepienie wykonano przed tymi procedurami (10.02.2022).
25. Rekomendacje Zespołu ds. Szczepień dotyczące okresu karencji przed szczepieniem przeciw COVID-19 (18.02.2022).
26. Rekomendacja Zespołu ds. Szczepień Ochronnych w rozszerzonym składzie eksperckim dla Ministra Zdrowia dotycząca stosowania szczepionki przeciw COVID-19 Nuvaxovid (21.02.2022)
27. Rekomendacja Zespołu ds. Szczepień Ochronnych w rozszerzonym składzie eksperckim dla Ministra Zdrowia dotycząca szczepień przeciw COVID-19 osób z Ukrainy (07.03.2022).
28. Stanowisko Zespołu ds. Szczepień Ochronnych przy Ministrze Zdrowia w sprawie stosowania szczepionki przeciw COVID-19 Spikevax (Moderna) u dzieci w wieku 6-11 lat (25.03.2022).
29. Stanowisko Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dla Ministra Zdrowia dotyczące informacji Głównego Inspektora Sanitarnego dla lekarzy i podmiotów leczniczych wykonujących szczepienia akcyjne u pełnoletnich wolontariuszy udzielających pomocy uchodźcom z Ukrainy (data 04.04.2022).
30. Rekomendacja Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dla Ministra Zdrowia dotycząca podawania drugiej dawki przypominającej szczepionki przeciw COVID-19 (11.04.2022).
31. Rekomendacja Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dla Ministra Zdrowia dotycząca podawania czwartej dawki szczepionki przeciw COVID-19 osobom z zaburzeniami odporności (18.05.2022)
32. Rekomendacja Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dla Ministra Zdrowia dotycząca podawania drugiej dawki przypominającej szczepionki przeciw COVID-19 (18.07.2022).
33. Rekomendacja Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dla Ministra Zdrowia dotycząca podawania drugiej dawki przypominającej szczepionki przeciw COVID-19 pracownikom ochrony zdrowia (10.08.2022).
34. Rekomendacja Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dla Ministra Zdrowia w sprawie realizacji szczepień przypominających przeciw COVID-19 przy użyciu szczepionek zaktualizowanych dla wariantu Omikron (14.09.2022).
35. Stanowisko Zespołu ds. Szczepień Ochronnych w sprawie szczepień przypominających przeciw COVID-19 dzieci w wieku 5-11 lat (26.09.2022).
36. Stanowisko Zespołu ds. Szczepień Ochronnych w sprawie szczepień przeciw COVID-19 dzieci w wieku 6 miesięcy – 4 lata (25.10.2022).
37. Stanowisko Zespołu ds. Szczepień Ochronnych dla Ministra Zdrowia w sprawie stosowania biwalentnych szczepionek przeciw COVID-19 w podstawowych schematach szczepień dzieci i młodzieży (14.12.2022).