Na podstawie rezolucji Rady Bezpieczeństwa ONZ nr 1088 z dnia 12 grudnia 1996r. siły implementacyjne zostały zredukowane i przemianowane na Siły Stabilizujące SFOR. Polscy żołnierze wykonywali zadania mandatowe w rejonie misji w ramach NORDPOLBDE jako PKW SFOR.

W czerwcu 2004r. na szczycie NATO w Stambule podjęło decyzję o przekazaniu misji Sił Stabilizacyjnych w BiH siłom Unii Europejskiej, które oficjalnie przejęły od NATO odpowiedzialność z kontynuowanie operacji 2 grudnia 2004r. Siły Unii Europejskiej (EUFOR ALTHEA) działają w ścisłej współpracy z NATO.  Celem misji oprócz zapewnienia „bezpiecznego środowiska" w BiH było nawiązanie ściślejszej współpracy z innymi agendami Unii Europejskiej obecnymi w tym regionie. Unia Europejska i NATO współdziałają ze sobą w BiH na podstawie dokumentów znanych jako „Berlin-Plus” (nazwa wywodzi się od miejsca spotkania ministrów spraw zagranicznych NATO w 1996 roku). Zgodnie z tymi ustaleniami, Unia Europejska korzysta z potencjału planowania NATO oraz wykorzystuje te same wojskowe kwatery dowodzenia, działając za pośrednictwem komórek UE ulokowanych zarówno w Najwyższym Dowództwie Sił Sprzymierzonych Europy w Mons (Belgia), jak i Dowództwie Połączonych Sił Zbrojnych w Neapolu – dowództwie operacyjnym natowskich misji na Bałkanach. Od grudnia 2004r. Polski Kontyngent Wojskowy realizował zadania w składzie Wielonarodowych Sił Zadaniowych „Północ” – MNTF(N) EUFOR. PKW EUFOR stacjonował w bazie w Tuzli. W pierwszej połowie 2007r. Unia Europejska uznała, że BiH poczyniła znaczne postępy w osiągnięciu celów swej polityki i zredukowała siły w rejonie operacji. W tym samym roku dokonano także przeniesienia Polskiego Kontyngentu Wojskowego do bazy Butmir w Sarajewie, gdzie polscy żołnierze stacjonują do chwili obecnej.  

Kolejne zmiany w siłach międzynarodowych, a tym samym w Polskim Kontyngencie Wojskowym podyktowane były postępującym procesem stabilizacji. Polska zredukowała liczebność żołnierzy do 50 i skupiła swój wysiłek na kwestiach szkolenia, doradzania i monitorowania dla Sił Zbrojnych Bośni i Hercegowiny.

1 grudnia 2010 roku rozpoczęła realizację zadań szkoleniowo-doradczych I zmiana PKW EUFOR/MTT tym samym ostatecznie zakończyło to etap stabilizacyjny w historii kontyngentu.

Obecnie głównym zadaniem stojącym przed polskimi żołnierzami PKW w operacji wojskowej Unii Europejskiej w Bośni i Hercegowinie w ramach sił EUFOR jest szkolenie i doradzanie oraz budowa wybranych zdolności bojowych SZ BiH zgodnie ze standardami NATO i UE, oraz monitorowania przestrzegania porozumień i traktatów międzynarodowych w przydzielonym rejonie odpowiedzialności. Ponadto PKW realizuje szereg przedsięwzięć związanych ze wspieraniem władz lokalnych w utrzymaniu bezpiecznych warunków  do wdrażania ustaleń zawartych w porozumieniach pokojowych. Poza działaniami ściśle szkoleniowymi PKW wspomaga i organizuje pomoc humanitarną, jak również prowadzi zajęcia ze świadomości minowej.

1. Siły (własne – na teatrze):

-   Dowództwo PKW
-   Narodowa Komórka Kontrwywiadu (NKK)
-   Narodowa Komórka Wywiadu (NKW)                                  

2. Siły (własne - wydzielane w podporządkowanie d-com/szefom komórek EUFOR):

-   Personel w Kwaterze Głównej EUFOR(HQ EUFOR)
-   Zespół Doradczy (EAT - Embedded Advisory Team) przy Dowództwie 6.BP SZ BiH
-   Zespół Szkoleniowy - transport i ruch wojsk (MTT-1 – Mobile Training Team)
-   ZespółSzkoleniowy (LL EAT – Lessons Learned Embedded Advisory Team)
-   Personel w Międzynarodowej Grupie Żandarmerii Wojskowej (IMP – International Military Police)
-   Oficer w Centrum KoordynacjiZespołówLOT(LCC – Liason Coordination Center LOT)
-   Zespół Łącznikowo – Obserwacyjny (LOT – LiasonObservation Team)

Zgodnie z decyzjami politycznymi i wojskowymi Polski Kontyngent Wojskowy EUFOR realizujący zadania stabilizacyjne w Bośni i Hercegowinie 30 listopada 2010 roku zakończył swoją działalność. 1 grudnia zadania doradczo-szkoleniowe w Bośni i Hercegowinie rozpoczął Polski Kontyngent Wojskowy PKW EUFOR/MTT (ang. Mobile Training Teams), w którego skład wchodzą cztery Mobilne Zespoły Szkoleniowe oraz 2 Zespoły Łącznikowe-Obserwacyjne. Ponadto Polacy służą także w kwaterze Sił EUFOR oraz w Europejskim Oddziale Żandarmerii Wojskowej. 

Polski Kontyngent Wojskowy PKW EUFOR/MTT realizuje misję o charakterze szkoleniowo – doradczym.

Do głównych zadań Polskiego Kontyngentu Wojskowego należą: szkolenie i budowa zdolności wojskowych Sił Zbrojnych Bośni i Hercegowiny, monitorowanie sytuacji bezpieczeństwa, współpraca z przedstawicielami władz samorządowych, instytucji publicznych i organizacji pozarządowych w strefie odpowiedzialności.

Polski Kontyngent Wojskowego EUFOR/MTT w Bośni i Hercegowinie liczy do 50 żołnierzy i pracowników Wojska Polskiego.

Zgodnie z postanowieniem Prezydenta RP misja została przedłużona do 3 listopada 2023 r.